সরকারি বি.এল. কলেজের প্রতিষ্ঠা লাভের সাত বছর পর ১৯০৯ সালে ড.পি ব্রুলের সুপারিশে বিজ্ঞান বিভাগ চালু হওয়ার সময় থেকে উদ্ভিদবিজ্ঞান বিষয়ের যাত্রা শুরু। কলেজ মসজিদের পাশে অবস্থিত পুকুরের উত্তর পাড়ে ভগ্ন প্রায় দুই/তিনটি কক্ষে তখন বিভাগের সকল কার্যাবলী চলতে থাকে। ১৯৮৪ সালে নতুন ভবনে অর্থাৎ জীববিজ্ঞান ভবনের নিচতলায় স্থানান্তরিত হওয়ার পর স্নাতক সম্মান ও স্নাতকোত্তর শ্রেণীর পাঠদানের উপযোগী প্রশস্থ শ্রেণীকক্ষ, গবেষণাগার, সেমিনার কক্ষ, শিক্ষকবৃন্দের বসার ঘর, ভান্ডারে সুসজ্জিত বিভাগটি নতুন আঙ্গিকে যাত্রা শুরু করে। ১৯৭৫ সালে উদ্ভিদবিজ্ঞান সম্মান কোর্স খোলা হয়। ১৯৯৪ সাল থেকে এম.এস.সি পার্ট-১ এবং ১৯৯৫ সাল থেকে এম.এস.সি পার্ট-২ শ্রেণীতে পাঠদান শুরু হয়। দুইটি প্রদর্শক শিক্ষক পদসহ বিভাগে বর্তমানে ১৪টি পদ আছে।

এ বিভাগে একটি সমৃদ্ধ পাঠাগার রয়েছে। পাঠাগারে প্রায় দুই সহস্রাধিক বই রয়েছে। সেমিনার গ্রন্থাগার, যা নিয়মিতভাবে সমৃদ্ধ হয় নিত্য নতুন পুস্তকের সংযোজনে- সেখানে এ বিভাগের শিক্ষার্থীরা শুধু পুস্তকের সুবিধাই গ্রহণ করে না, বিভিন্ন অনুষ্ঠানে মুখরিত করে রাখে বিভাগের আঙ্গিনা । প্রতিবছরের শিক্ষাভ্রমণেও বাড়িয়ে থাকে শিক্ষার্থীদের জ্ঞানের পরিধি। বিভাগের লেখাপড়া তথা ফলাফলের মান সন্তোষজনক।